全球最大数字微生物数据库建成

来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手，成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”（APOLLO）。“阿波罗”囊括了247092个计算模型，其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型，有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。

数字微生物（艺术图）。图片来源：爱尔兰高威大学

研究团队重点关注了细菌微生物组，即那些栖息于人体内外的细菌群落。他们基于真实样本，创建了14451个微生物群落的计算模型，每个模型都展示了这些群落内不同微生物代谢如何随身体部位、年龄和健康状况的变化而变化。这些计算模型依据的样本分布身体不同部位，跨越不同年龄，是迄今最全面的人类微生物组计算模型的集合。“阿波罗”还预测了与克罗恩病、帕金森病和儿童营养不良有关的关键代谢物，为开发诊断和治疗新策略提供了宝贵线索。

研究团队表示，这一数据库将成为科学家探索微生物在人体内功能、微生物与健康和疾病相互作用的新利器，降低对繁琐的活体生物实验的依赖。

这一成果基于团队长达十年的专业知识，从早期涵盖数百种微生物的“重建和分析肠道微生物代谢”（AGORA）项目，到涵盖数千种微生物的AGORA2，再到现在的“阿波罗”。

研究团队表示，通过识别微生物代谢标志物，“阿波罗”可以帮助科学家开发非侵入性诊断工具，更早且更准确地诊断出疾病。这些模拟还能预测个体的微生物组与其饮食、药物和健康状况之间的相互作用，带来更具针对性的益生菌、益生元和基于微生物组的个性化疗法，帮助个人优化肠道健康，更有效地治疗特定疾病。