ao %>% filter(grepl(term, trait, ignore.case = T)) %>% View() data <- ao %>% filter(grepl(term, trait, ignore.case = T)

动态 未结 0 139
小小草
小小草 LV1 2023年9月23日 23:40 发表
这段代码的功能是: 1. 使用 `filter()` 函数从数据框 ao 中筛选出包含 term 字符串的 trait 列,并将结果保存到 data 变量中。 2. 使用 `extract_instruments()` 函数从 data$id 列中提取基因型仪器变量,并将结果保存到 inst 变量中。`clump = F` 参数表示不进行聚类,`p1=10e-8` 参数表示使用 P 值阈值为 10^-8 进行筛选。 3. 使用 `count()` 函数对 inst 中的 id.exposure 列进行计数,并将结果保存到 ids 变量中。 4. 使用 `%>%` 管道操作符和 `filter()` 函数从 ao 数据框中筛选出 ids$id.exposure 列中的 ID,并将结果保存到一个新的数据框中。 5. 使用 `select()` 函数选择需要的列,并使用 `left_join()` 函数将 ids 变量中的计数结果添加到新的数据框中。 6. 使用 `extract_instruments()` 函数从 ids$id.exposure 列中提取基因型仪器变量,并将结果保存到 inst_sign 变量中。 7. 最后,使用 `extract_instruments()` 函数从单个 ID "prot-a-1936" 中提取基因型仪器变量,并使用 `clump_data()` 函数进行聚类。
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